UGB-DC-4.4 01 Unidad Genómica Aranceles Vigentes

Instituto de Biotecnología
Código: UGB-DC-4.4/01
Versión : 05
Unidad de Genómica
Centro de Investigación en
Ciencias Veterinarias y
Agronómicas
Fecha vigencia: 13/04/2015
Aranceles Vigentes
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Política de precios de la Unidad de Genómica
La Unidad de Genómica del Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria presta
servicios en el área de la genómica a los laboratorios de investigación y desarrollo de
las distintas Estaciones Experimentales y Centros de Investigaciones de INTA y otras
instituciones públicas y privadas del país. Su misión es brindar apoyo tecnológico a la
comunidad científica nacional y regional con el objetivo de incrementar cualicuantitativamente el desarrollo de capacidades nacionales en biotecnología y recursos
Genéticos.
La UGB cuenta con las siguientes aplicaciones:
1) Secuenciación de ADN por Electroforesis capilar
Para esta aplicación se utiliza la técnica de Sanger y la electroforesis por capilares en
secuenciadores automáticos.
El resultado del análisis de secuenciación consta de tres archivos:
 Uno con extensión .abI que contiene la secuencia de ADN y un electroferograma
que puede ser interpretado por el/la [email protected]
 Un archivo con extensión .phd que contiene los índices de Phred de cada una de
las bases obtenidas.
 Un tercer archivo con extensión .seq que contiene la secuencia de nucleótidos
de ADN en un formato requerido por varios programas de uso para el análisis
posterior de los resultados.
Para realizar este análisis se reciben muestras de diferentes tipos de ADN: Plasmídico,
Genómico, BACs, Cósmidos, Productos de PCR.
No se cobra costo adicional por utilizar los oligonucleótidos universales con los que
cuenta el servicio.
2) Genotipificación por electroforesis capilar
Para el análisis de marcadores moleculares se hace una corrida electroforética de
la muestra en secuenciadores automáticos junto con un marcador de peso molecular
interno, que es provisto por la Unidad de Genómica. El resultado del análisis es un
archivo .fsa que debe ser analizado por un programa específico para genotipificación
(GeneMapper, Applied Biosystems).
La Unidad de genómica cuenta con computadoras con el programa GeneMapper
habilitadas para el uso de [email protected] [email protected], si así lo requieren, sin costo adicional.
Aranceles de Secuenciación y Genotipificación por Electroforesis Capilar
Sec. Ordinarias (U$S) Sec. BAC/COS (U$S) Genotipificación (U$S)
Interno
5
7
3
5,5
8
3,5
Entidades Públicas
6
9
4,2
Entidades Privadas
11
15
6
INTA
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3) Análisis de ácidos nucleicos por electroforesis capilar
Para el análisis de ácidos nucleicos se dispone de un equipo de electroforesis capilar
(Fragment Analyzer ™ system, Advanced Analytical) que establece el tamaño y la
concentración de los fragmentos de ADN o ARN separados. Los datos son analizados
con el software PROSize® 2.0 y los resultados se generan en formato PDF, Excel o
una imagen digital.
Esta aplicación incluye la posibilidad de realizar análisis de marcadores moleculares y
análisis de mutaciones provenientes de amplificaciones con oligonucleótidos no
marcados, ya que utiliza un intercalante universal.
Consultar disponibilidad de kits y consideraciones sobre la preparación de muestras.
Los aranceles son generales para todos [email protected] [email protected], dependen del kit a utilizar y
están descriptos en la siguente tabla:
Kits Disponibles
Sensibilidad
Rango de tamaño
Costo U$S
50 bp – 5,000 bp
Rango de
Concentración
5 ng/μL – 100 ng/μL
Cuantitativo
ADN/NGS
Cuantitativo
ADN/NGS
Cuantitativo ADN
Genómico
Cuantitativo RNA
total
Cuantitativo RNA
total
Cualitativo/tamaño
dsDNA
Mutaciones
DNA<1000 bp
Mutaciones
DNA>1000 bp
estandar
Alta
50 bp – 5,000 bp
50 pg/μL – 5,000 pg/μL
4.1
Estandar
50 bp – 40,000 bp
5 ng/μL – 200 ng/μL
4.0
estandar
35 b – 6,000 b
5 ng/μL – 500 ng/μL
4.0
Alta
35 b – 6,000 b
50 pg/μL – 5,000 pg/μL
4.0
Estandar
35 bp – 500 bp
5 ng/μL – 50 ng/μL
2.0
Estandar
35 bp – 5,000 bp
5 ng/μL – 100 ng/μL
2.0
Estandar
35 bp – 5,000 bp
5 ng/μL – 100 ng/μL
2.0
4.1
NUEVAS TECNOLOGÍAS DE SECUENCIACIÓN Y GENOTIPIFICACIÓN DE ALTO
RENDIMIENTO
Estos ensayos requieren de un asesoramiento previo a la solicitud, por favor contactarse
con la responsable del laboratorio. Las aplicaciones se presupuestarán según los
ensayos a desarrollar.
4) Genotipificación mediante marcadores SNP por microarreglos: ensayos
GoldenGate-Vera Code en lectores BeadXpress (Illumina)
5) Secuenciación de alto rendimiento: Secuenciación por síntesis en
secuenciador Miseq (Illumina)
-
Secuenciación de genomas pequeños
Secuenciación de genomas eucariotas
Secuenciación de plásmidos
Secuenciación de amplicones
RNAseq
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Consideraciones adicionales
El horario para la recepción de las muestras es de 9 hs a 16:30 hs. en las instalaciones
del laboratorio.
También se reciben muestras enviadas por correo o encomienda, en cuyo caso la
entrada de la muestra en la Unidad será en el momento de recibir el despacho (las
muestras recibidas después de las 15 hs serán entradas al sistema el día hábil
siguiente). La responsabilidad sobre las condiciones del transporte de las muestras esta
a cargo del/ de la [email protected]
En ningún caso, ni el INTA, ni el Instituto de Biotecnología, ni ninguna persona
relacionada con los mismos, asume ninguna responsabilidad relacionada o derivada con
el uso de los resultados del análisis realizado. Los resultados del presente análisis no
pueden ser usados para fines publicitarios u otros usos no autorizados previamente por
el INTA.
Pago
[email protected] de INTA: a través de Proyectos Nacionales y de otras fuentes de financiación
(proyectos ANPCyT, MinCyT).
Usuarios/as extra INTA:
Disponemos de tres formas de pago a la Unidad de Genómica, a través de la administradora
Fundación ArgenInta:
1) Transferencia bancaria (a la cuenta Fundación ArgenInta)
CUIT 30-67630365-7
Banco de la Nación Argentina
Sucursal Bella Vista ( Bs. As.)
Nº Cta. Cte. 6990007837
CBU 0110699820069900078377
2) Efectivo (acercándose a la UGB, INTA Castelar, Instituto de Biotecnología, en el
horario de 13 a 16 hs.)
3) Cheque (a nombre de Fundación ArgenInta no a la Orden).
Si se realiza una transferencia bancaria, se deberá enviar el comprobante vía mail o fax,
junto con los datos obligatorios a incluir en la factura (razón social, número de CUIT,
dirección, CP, Ciudad). Con estos datos se tramita la factura y luego se envía a quien
corresponda a la dirección postal que se indique.
El tiempo estimado de realización de la factura por parte de Fundación ArgeniNTA es de
al menos 48hs hábiles, según sus procedimientos de Calidad, habitualmente se
entregan en 3 a 5 días hábiles.
Los comprobantes pueden ser retirados en la UGB, los días hábiles de 9 a 17 hs. o
enviarse por correo postal certificado, ya que por ser un documento legal no se debe
enviar por correo simple.
Se notifica que partir de 2015 el envío por correo postal será abonado por el/la [email protected]
lo que se verá reflejado en cada resumen.